Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERBB4Q15303 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ERBB4Q15303 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
ERBB4Q15303 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB4Q15303 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms