Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFRLQ15198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRLQ15198 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRLQ15198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms