Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCF4Q15080 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCF4Q15080 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCF4Q15080 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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