Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCARF1Q14162 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCARF1Q14162 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCARF1Q14162 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCARF1Q14162 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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