Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFR3AQ14156 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFR3AQ14156 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFR3AQ14156 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms