Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H3Q13889 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H3Q13889 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H3Q13889 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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