Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EXOSC2Q13868 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC2Q13868 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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