Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XRCC4Q13426 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
XRCC4Q13426 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC4Q13426 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
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