Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2BQ13224 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2BQ13224 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2BQ13224 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GRIN2BQ13224 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2BQ13224 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
GRIN2BQ13224 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
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