Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD4Q12950 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXD4Q12950 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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FOXD4Q12950 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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FOXD4Q12950 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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FOXD4Q12950 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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