Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCB1Q12824 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCB1Q12824 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCB1Q12824 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCB1Q12824 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
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