Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 TIP41YPR040W 1071 nt5.76□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 MPA43YNL249C 1629 nt5.76□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 JIP4YDR475C 2631 nt5.76□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 GIR2YDR152W 798 nt5.75□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 PTR2YKR093W 1806 nt5.75□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 RKM4YDR257C 1485 nt5.75□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 DEF1YKL054C 2217 nt5.75□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 VHT1YGR065C 1782 nt5.75□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YNL247WYNL247W 2304 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 MTC5YDR128W 3447 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 snR78snR78 87 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 SPC42YKL042W 1092 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 HCR1YLR192C 798 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 MRI1YPR118W 1236 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 HER2YMR293C 1395 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YEF1YEL041W 1488 nt5.74□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 NUD1YOR373W 2556 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YDL034WYDL034W 345 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 SNF11YDR073W 510 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 MPC1YGL080W 393 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 SYN8YAL014C 768 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YBL070CYBL070C 321 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 PET20YPL159C 762 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 VPS5YOR069W 2028 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 SPO77YLR341W 1434 nt5.73□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 ARH1YDR376W 1482 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 SUA5YGL169W 1281 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 LSM12YHR121W 564 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YET2YMR040W 483 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 CAR1YPL111W 1002 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 RPN7YPR108W 1290 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 HAS1YMR290C 1518 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 MKK1YOR231W 1527 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 YAP1801YHR161C 1914 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 VPS4YPR173C 1314 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 ATF1YOR377W 1578 nt5.72□□□□□ -1.49
LCB4Q12246 VPS72YDR485C 2388 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YFL042CYFL042C 2025 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 KNH1YDL049C 807 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 THI4YGR144W 981 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 SAS4YDR181C 1446 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 CLD1YGR110W 1338 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 TEA1YOR337W 2280 nt5.71□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YFR006WYFR006W 1608 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RSC2YLR357W 2670 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 COX26YDR119W-A 201 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RTN1YDR233C 888 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 COS9YKL219W 1224 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 MSA2YKR077W 1092 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 DAL82YNL314W 768 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 HEM15YOR176W 1182 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 FES1YBR101C 873 nt5.7□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PMT2YAL023C 2280 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 SSK22YCR073C 3996 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 SRG1SRG1 551 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 CAD1YDR423C 1230 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 GTO1YGR154C 1071 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YGR176WYGR176W 348 nt5.69□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YJU2YKL095W 837 nt5.68□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 REX3YLR107W 1215 nt5.68□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PIN2YOR104W 849 nt5.68□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 HXK2YGL253W 1461 nt5.68□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YEH1YLL012W 1722 nt5.68□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 AIM17YHL021C 1398 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 SMF2YHR050W 1650 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YGL036WYGL036W 2730 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YDR132CYDR132C 1488 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YGR066CYGR066C 879 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 DAL3YIR032C 588 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 GON7YJL184W 372 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RRT7YLL030C 342 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YLL059CYLL059C 507 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PGA3YML125C 939 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 GFD1YMR255W 567 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RDL1YOR285W 420 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 MLC2YPR188C 492 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 SHE10YGL228W 1734 nt5.67□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YMR027WYMR027W 1413 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PYC1YGL062W 3537 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 snR57snR57 88 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PRO3YER023W 861 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PCL6YER059W 1263 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 MLC1YGL106W 450 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 EDC1YGL222C 528 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RBD2YPL246C 789 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 LPL1YOR059C 1353 nt5.66□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 TIM54YJL054W 1437 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 CLB2YPR119W 1476 nt5.65□□□□□ -1.5
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