Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC15Q0P6D6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC15Q0P6D6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC15Q0P6D6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms