Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM27E3Q08E93 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM27E3Q08E93 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM27E3Q08E93 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms