Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDE4DQ08499 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4DQ08499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4DQ08499 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms