Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 MID1YNL291C 1647 nt5.24□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 RRT7YLL030C 342 nt5.24□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.24□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 YDR132CYDR132C 1488 nt5.24□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 ENT2YLR206W 1842 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 ROG3YFR022W 2202 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 RTT103YDR289C 1230 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 PRE3YJL001W 648 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 ZRT2YLR130C 1269 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 YLR317WYLR317W 435 nt5.23□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 TAH18YPR048W 1872 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 CST6YIL036W 1764 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 YDR109CYDR109C 2148 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 PCL6YER059W 1263 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 NPA3YJR072C 1158 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 YKR075CYKR075C 924 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 GSY2YLR258W 2118 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 ECM7YLR443W 1347 nt5.22□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 VTH1YIL173W 4650 nt5.21□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 VTH2YJL222W 4650 nt5.21□□□□□ -1.57
SSK1Q07084 RKM4YDR257C 1485 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 ARP10YDR106W 855 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 NCS6YGL211W 1080 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 GTO1YGR154C 1071 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 DJP1YIR004W 1299 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 KRE9YJL174W 831 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 QRI5YLR204W 336 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 CTR1YPR124W 1221 nt5.21□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YML082WYML082W 1950 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 MOG1YJR074W 657 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SFC1YJR095W 969 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YLR296WYLR296W 327 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 POR1YNL055C 852 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 CAF40YNL288W 1122 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 RPO26YPR187W 468 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.2□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 AAP1YHR047C 2571 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YDR396WYDR396W 501 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YGL072CYGL072C 360 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 KSS1YGR040W 1107 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 DOT5YIL010W 648 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 MAD2YJL030W 591 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 PML1YLR016C 615 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 ISR1YPR106W 1332 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 APE3YBR286W 1614 nt5.19□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YDR015CYDR015C 240 nt5.18□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 ATO3YDR384C 828 nt5.18□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YHP1YDR451C 1062 nt5.18□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 MRPL25YGR076C 474 nt5.18□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 RBD2YPL246C 789 nt5.18□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 UBA1YKL210W 3075 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YAP1801YHR161C 1914 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 IMG2YCR071C 441 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 VCX1YDL128W 1236 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SEC20YDR498C 1152 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 LEU5YHR002W 1074 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YET2YMR040W 483 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 RHO2YNL090W 579 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 RRT2YBR246W 1164 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 GYP1YOR070C 1914 nt5.17□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 ASH1YKL185W 1767 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 AMD1YML035C 2433 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 MAL11YGR289C 1851 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 COX20YDR231C 618 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 BMT5YIL096C 1011 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 RPS5YJR123W 678 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SCP1YOR367W 603 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 CLP1YOR250C 1338 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 VNX1YNL321W 2727 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 LPL1YOR059C 1353 nt5.16□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SPO77YLR341W 1434 nt5.15□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 SMF2YHR050W 1650 nt5.15□□□□□ -1.58
SSK1Q07084 UPS3YDR185C 540 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 MTF1YMR228W 1026 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 GFD1YMR255W 567 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 PSH1YOL054W 1221 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 MLC2YPR188C 492 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 OXP1YKL215C 3861 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 WTM1YOR230W 1314 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 VPS1YKR001C 2115 nt5.15□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 PMT2YAL023C 2280 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 MMR1YLR190W 1476 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YDL129WYDL129W 876 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YJL193WYJL193W 1209 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 DBR1YKL149C 1218 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 COX17YLL009C 210 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 YML131WYML131W 1098 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 PEX12YMR026C 1200 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RPC19YNL113W 429 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 AVO1YOL078W 3531 nt5.14□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 PIF1YML061C 2580 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 VMS1YDR049W 1899 nt5.13□□□□□ -1.59
SSK1Q07084 RAM1YDL090C 1296 nt5.13□□□□□ -1.59
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