Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KDSRQ06136 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDSRQ06136 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDSRQ06136 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms