Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRSF11Q05519 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRSF11Q05519 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms