Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 ATG23YLR431C 1362 nt6.52□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 YHR045WYHR045W 1683 nt6.52□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 COX9YDL067C 180 nt6.51□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 TDH3YGR192C 999 nt6.51□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 EFM3YJR129C 1020 nt6.51□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 YOL036WYOL036W 2286 nt6.51□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 PRP24YMR268C 1335 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 DPH2YKL191W 1605 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 PAP1YKR002W 1707 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 RGD1YBR260C 2001 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SNZ3YFL059W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 NCS6YGL211W 1080 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SCW4YGR279C 1161 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SNZ2YNL333W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 RPS15YOL040C 429 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 UGO1YDR470C 1509 nt6.5□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SMF2YHR050W 1650 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 VPS72YDR485C 2388 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 TAL1YLR354C 1008 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 MRPL4YLR439W 960 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 YNR048WYNR048W 1182 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 PFK2YMR205C 2880 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 RPT1YKL145W 1404 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 VHT1YGR065C 1782 nt6.49□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SRP101YDR292C 1866 nt6.48□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 ATG7YHR171W 1893 nt6.48□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 TOS4YLR183C 1470 nt6.47□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 BNA5YLR231C 1362 nt6.47□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 HXT17YNR072W 1695 nt6.47□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 JJJ3YJR097W 519 nt6.47□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 KTR5YNL029C 1569 nt6.47□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 DPB2YPR175W 2070 nt6.46□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 THI21YPL258C 1656 nt6.46□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 REV7YIL139C 738 nt6.46□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 RDL2YOR286W 450 nt6.46□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 PSY4YBL046W 1326 nt6.46□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 CBF1YJR060W 1056 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 ECM15YBL001C 315 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 ATG33YLR356W 594 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 GFD1YMR255W 567 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 RER2YBR002C 861 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 SER1YOR184W 1188 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 VMA4YOR332W 702 nt6.45□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 NMT1YLR195C 1368 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 TEF1YPR080W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 TEF2YBR118W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 YJL068CYJL068C 900 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 YPR195CYPR195C 330 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 STL1YDR536W 1710 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 CHL4YDR254W 1377 nt6.44□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 ICE2YIL090W 1476 nt6.43□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 TAX4YJL083W 1815 nt6.43□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 YNL247WYNL247W 2304 nt6.43□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 AIM17YHL021C 1398 nt6.43□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 RMD9YGL107C 1941 nt6.42□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 UBC4YBR082C 447 nt6.42□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 MID1YNL291C 1647 nt6.42□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 YAP1YML007W 1953 nt6.42□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 GEP3YOR205C 1671 nt6.42□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 SUA5YGL169W 1281 nt6.41□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 GAT3YLR013W 426 nt6.41□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 RSA4YCR072C 1548 nt6.4□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 JAC1YGL018C 555 nt6.4□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 BUD28YLR062C 378 nt6.4□□□□□ -1.38
SYF1Q04048 UTP7YER082C 1665 nt6.39□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YDR134CYDR134C 411 nt6.39□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 ARO2YGL148W 1131 nt6.39□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YEH1YLL012W 1722 nt6.39□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 SIT1YEL065W 1887 nt6.39□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 EMW1YNL313C 2715 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PYC1YGL062W 3537 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PRP45YAL032C 1140 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 MIM2YLR099W-A 264 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 VPS4YPR173C 1314 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 ARO10YDR380W 1908 nt6.38□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YGL072CYGL072C 360 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 RPB4YJL140W 666 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YJU2YKL095W 837 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PRE7YBL041W 726 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PPR1YLR014C 2715 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 BPL1YDL141W 2073 nt6.37□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 LDB19YOR322C 2457 nt6.36□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YIL060WYIL060W 435 nt6.36□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 YBR016WYBR016W 387 nt6.36□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 CNM67YNL225C 1746 nt6.36□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 SEC18YBR080C 2277 nt6.36□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PAT1YCR077C 2391 nt6.35□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 CWC21YDR482C 408 nt6.35□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 APM4YOL062C 1476 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 DDC1YPL194W 1839 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 TUB2YFL037W 1374 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 ESC8YOL017W 2145 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 DED81YHR019C 1665 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 PAD1YDR538W 729 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 SOH1YGL127C 384 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 ALT2YDR111C 1524 nt6.34□□□□□ -1.39
SYF1Q04048 ASN1YPR145W 1719 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 RBD2YPL246C 789 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ECM2YBR065C 1095 nt6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.2 ms