Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC2Q02487 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC2Q02487 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSC2Q02487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms