Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF17Q02223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms