Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A2Q02221 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A2Q02221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms