Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC1Q01954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms