Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MC1RQ01726 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MC1RQ01726 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MC1RQ01726 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms