Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF9Q00978 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF9Q00978 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF9Q00978 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF9Q00978 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms