Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNA1BQ00975 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNA1BQ00975 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1BQ00975 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA1BQ00975 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms