Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FGD1P98174 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FGD1P98174 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FGD1P98174 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD1P98174 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD1P98174 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD1P98174 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FGD1P98174 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FGD1P98174 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FGD1P98174 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGD1P98174 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD1P98174 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD1P98174 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FGD1P98174 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FGD1P98174 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FGD1P98174 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FGD1P98174 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD1P98174 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FGD1P98174 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD1P98174 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD1P98174 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD1P98174 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD1P98174 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FGD1P98174 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms