Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC5P78333 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPC5P78333 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC5P78333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC5P78333 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC5P78333 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC5P78333 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC5P78333 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC5P78333 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC5P78333 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC5P78333 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC5P78333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC5P78333 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC5P78333 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC5P78333 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC5P78333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC5P78333 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC5P78333 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC5P78333 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC5P78333 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC5P78333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC5P78333 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC5P78333 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC5P78333 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC5P78333 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC5P78333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC5P78333 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC5P78333 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms