Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SIRPAP78324 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIRPAP78324 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIRPAP78324 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SIRPAP78324 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SIRPAP78324 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms