Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBG1P69891 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBG1P69891 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBG1P69891 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBG1P69891 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBG1P69891 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBG1P69891 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBG1P69891 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBG1P69891 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBG1P69891 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBG1P69891 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBG1P69891 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBG1P69891 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms