Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL38P63173 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL38P63173 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL38P63173 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL38P63173 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL38P63173 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL38P63173 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL38P63173 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL38P63173 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL38P63173 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL38P63173 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL38P63173 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL38P63173 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL38P63173 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL38P63173 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL38P63173 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL38P63173 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL38P63173 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL38P63173 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL38P63173 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL38P63173 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms