Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUMO1P63165 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUMO1P63165 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO1P63165 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SUMO1P63165 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms