Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RPS29P62273 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPS29P62273 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPS29P62273 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPS29P62273 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPS29P62273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPS29P62273 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPS29P62273 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPS29P62273 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPS29P62273 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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