Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPS16P62249 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS16P62249 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS16P62249 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS16P62249 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS16P62249 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS16P62249 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS16P62249 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS16P62249 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS16P62249 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS16P62249 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS16P62249 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS16P62249 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS16P62249 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS16P62249 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPS16P62249 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS16P62249 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS16P62249 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS16P62249 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS16P62249 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS16P62249 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS16P62249 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS16P62249 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS16P62249 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS16P62249 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms