Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTR3P61158 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTR3P61158 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms