Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB2AP61019 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB2AP61019 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms