Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRPS1P60891 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRPS1P60891 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPS1P60891 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms