Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVFC1-1P60608 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVFC1-1P60608 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms