Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN2P57739 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN2P57739 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN2P57739 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN2P57739 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN2P57739 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN2P57739 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN2P57739 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms