Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GEMIN4P57678 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GEMIN4P57678 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms