Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG3P56975 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG3P56975 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG3P56975 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG3P56975 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRG3P56975 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRG3P56975 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRG3P56975 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRG3P56975 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRG3P56975 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRG3P56975 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRG3P56975 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRG3P56975 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NRG3P56975 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms