Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSCP56915 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSCP56915 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSCP56915 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSCP56915 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSCP56915 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSCP56915 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSCP56915 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSCP56915 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GSCP56915 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GSCP56915 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSCP56915 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSCP56915 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSCP56915 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSCP56915 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSCP56915 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSCP56915 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSCP56915 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSCP56915 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSCP56915 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSCP56915 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSCP56915 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSCP56915 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSCP56915 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSCP56915 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSCP56915 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSCP56915 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSCP56915 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GSCP56915 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSCP56915 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSCP56915 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSCP56915 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSCP56915 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSCP56915 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms