Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1P56715 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RP1P56715 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RP1P56715 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1P56715 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1P56715 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RP1P56715 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RP1P56715 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RP1P56715 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RP1P56715 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1P56715 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1P56715 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1P56715 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1P56715 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RP1P56715 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RP1P56715 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RP1P56715 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RP1P56715 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RP1P56715 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RP1P56715 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RP1P56715 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RP1P56715 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RP1P56715 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RP1P56715 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms