Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTCP1P56278 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTCP1P56278 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms