Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OXCT1P55809 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OXCT1P55809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OXCT1P55809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms