Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH8P55286 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH8P55286 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH8P55286 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH8P55286 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH8P55286 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH8P55286 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH8P55286 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH8P55286 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH8P55286 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH8P55286 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH8P55286 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH8P55286 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH8P55286 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH8P55286 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH8P55286 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH8P55286 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH8P55286 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH8P55286 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH8P55286 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH8P55286 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH8P55286 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH8P55286 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH8P55286 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH8P55286 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH8P55286 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH8P55286 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH8P55286 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH8P55286 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH8P55286 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH8P55286 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH8P55286 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH8P55286 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms