Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASP9P55211 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASP9P55211 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASP9P55211 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP9P55211 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP9P55211 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP9P55211 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP9P55211 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP9P55211 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP9P55211 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP9P55211 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP9P55211 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP9P55211 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP9P55211 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP9P55211 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms