Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D1P54289 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D1P54289 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D1P54289 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms