Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRISP1P54107 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRISP1P54107 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRISP1P54107 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRISP1P54107 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRISP1P54107 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRISP1P54107 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRISP1P54107 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRISP1P54107 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP1P54107 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP1P54107 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms