Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RND2P52198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RND2P52198 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RND2P52198 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RND2P52198 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RND2P52198 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RND2P52198 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RND2P52198 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RND2P52198 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RND2P52198 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RND2P52198 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms